应用快照:自动液体处理

世界各地的客户已经使用Opentrons来自动完成各种基本的实验室液体处理任务。这是如何。

注:除了更复杂的任务,如NGS库准备,核酸提取和qPCR,您还可以使用Opentrons平台自动完成大量基本的液体处理湿实验室任务。

在此快照中,您将学习如何自动化基本移液湿式实验室任务 - 包括管填充,微孔板填充,连续稀释和复合串行稀释 - 使用Opentrons硬件,软件,耗材和协议。您还将学习优化实验室工作流程以自动化这些任务的最佳实践,以及已下载Opentrons协议的任务。

常问问题

问:Opentrons平台在我的实验室里是如何工作的?

答:平台是开源所以任何实验都可以使用它,可根据不同的工作流程,并套件不可知。

问:如何制作基本的液体处理协议?

A:你有三种不同的选择来制定基本的液体处理协议:

-选项1:设计您自己与我们的互动,用户友好金宝搏188d网址工具

- 选项2:使用我们的开源代码您自己的代码Python协议API.

选项3:让我们的应用工程团队为您创建协议

问:你有什么事先写好的协议给我用吗?

答:我们有许多可下载协议协议库,包括这些用于基本湿式实验室液体处理测定:

-归一化

-管填充

-质量规范

-板填充

-整除

-连续稀释

-&合并

-樱桃采摘

-细胞播种

问:我可以在Opentrons平台上使用什么样的实验设备?

答:开箱即用,OT-2可以支持任何标准,自动化兼容/SBS足迹孔板,加上各种卡扣和螺旋帽管,直到我们的圆锥形圆锥形管4合1管架。您可以在我们的产品中看到所有受支持的实验设备下载金宝搏188网址

问:你是否支持自定义实验室设备?

答:OT-2几乎可以与你现在使用的任何实验设备兼容,即使是定制的。

如果需要使用具有与普通微型板具有相同占用脚印的自定义实验室软件,您可以使用我们的时间内在几分钟内创建自定义实验室的定义LabWare创建者

如果您需要使用与普通微孔板不同的定制实验件,我们的应用工程师可以为您创建一个。或者,如果你有一些编程知识,你可以自己创造一个和3D打印括号或适配器以在甲板上使用它。

问:我需要知道如何编写使用Opentrons平台的代码吗?

答:你不需要知道如何编写使用Opentrons平台的代码。可以使用Opentrons的即插即用协议设计工具创建协议。我们还有一个应用工程团队来帮助客户建立协议。

问:我能看一下协议样本吗?

答:我们所有的协议都是开源的,可以免费使用GitHub.

问:OT-2需要多长时间______?

- 答:将20ul分发给所有96个井中的盘子?

问:将1UL添加到384孔板的所有孔中?

答:2分钟以最快的设置设置,单通道单通道P20 Gen2电子移液管

问:填充1ml管?

答:用Opentrons单通道P20 GEN2电子移液器吸7秒

问:我可以用OT-2处理小批量转移吗?

答:你可以精确地用1-20μl处理卷,用我们的Opentrons 8通道P20 Gen2电子移液管或Opentrons单通道P20 Gen2电子移液管。移液器被校准并在1μl设定值测试的工厂,并附上校准证书。但是,即使通过测试和认证,通过自动化空气排量移液处理低容量转移测试和优化确保他们符合您的规格。

问:你能把粘稠的液体转移到机器人上吗?

答:一些客户使用OT-2转移粘性液体,包括蜂蜜和血液。但是,由于OT-2使用空气位移移液技术,因此它没有针对粘性液体进行优化。由机器人传递的音量会与您进入OT-2软件的音量不同,因此可能需要额外的优化(例如,加热液体,使用宽孔提示旋转液体。

问:我能在OT-2中创造一个干净的环境吗?

是的。当配备了我们的HEPA模块,使OT-2外壳成为一个干净的工作环境。然而,Opentrons电子移液器不能进行高压灭菌,所以你需要使用过滤头来防止移液器内部的污染。另外,OT-2不支持紫外线消毒。

问:我可以用384孔板吗?

答:标准全裙边384孔板与OT-2完全兼容。但由于井的大小,我们建议在使用384孔板时仅使用OpenTrons单通道P20 Gen2电子移液管。使用较大的卷移液管,如opEntrons 8通道P300 Gen2电子移液器将是棘手的,因为这些尖端具有大直径,使得获得384孔板的小型井所需的精确实验室软件校准恰好努力实现。

如果你需要对你的384孔板进行温度控制,你需要找一个带a的铝热块标准SBS足迹与OpEntrons温度模块一起使用。

问:我需要使用你的建议吗?

答:购买后,您需要使用Opentrons Tips来设置和校准您的Opentrons OT-2。

虽然有可能使用Opentrons移液器使用任何通用钻孔尖端,但我们强烈建议您使用Opentrons提示与OpenTrons系统一起使用,因为它们已经专门设计并彻底测试,以确保与Opentrons电子移液器一起使用时的体积精度和精确度。我们的提示是具有价格竞争力并预先置于Opentrons软件中。

为了使用第三方提示,您需要一个定制的实验室定义,在许多情况下,还需要一个3d打印适配器来将提示盒放入OT-2 deck槽中。

问:你如何防止交叉污染?

答:OT-2有一些特殊的特点来管理液滴的形成气隙,触摸提示, 和吹熄

防止污染的最重要的事情是设置甲板和机器人的动作,以避免在干净的样品上操纵脏移液器。您可以通过可视化实验的甲板布局来确保这一点金宝搏188d网址,或者使用Python为机器人指定自己的XYZ路径。

您可能需要在甲板上使用储存器作为液体废物容器,以避免污染易受样品的长运动。如果是这样,而且您需要帮助,我们的应用程序工程团队可用于帮助您。

问:你能把样品从管到板的重新格式化,反之亦然吗?(即管到96孔板和多个96孔板到384孔板)

- 答:您可以使用OpenTrons平台进行重新格式化样本:唯一的约束是移液器卷。一个OpEntrons 8通道Gen2电子移液管不能用于进入管中的管或所有孔中的384孔板。为了用OpEntrons 8通道Gen2电子移液管重新重新格式化样品,您将需要处理在下游测定中的384孔板上的其他384孔板,或者使用Opentrons单通道Gen2电子移液管。

这是一个用8通道GEN2电子吸管将4个96孔板固定到384孔板上的例子:

问:Opentrons接受什么类型的输入来进行板的重新格式化/挑选?

答:我们有几种针对不同类型输入的预构建协议我们的择偶协议可以使用CSV作为源和目标well输入。如果您需要不同的协议,我们的应用工程团队可以为您定制一个。

问:你能与我的LIMS系统集成吗?

答:此时Opentrons不会提供任何正式支持的LIMS集成。但是,如果您的LIMS可以输出CSV,我们的一些预构建协议可以接受该文件作为输入。如果您需要额外的自定义,您可以始终要求我们的应用程序工程团队为您的LIMS格式化CSV作为输入,为您提供协议。另外,自从OpenTrons API.是完全开源的,如果您的团队中有人有编程能力,您可以编写自己的双向集成与您的LIMS,甚至远程运行协议。

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