Opentrons出版物和引文

在过去的四年里,科学家们已经在同行评议的出版物、预印本、会议论文、文章,甚至在他们的毕业论文项目中引用了近30次opentron,而这仅仅是开始!这里有几个例子。

在Opentrons,我们开始为生命科学家制造机器人,这样他们可以更快、更可重复地进行研究。

它的工作。

在过去的四年里,我们已经看到近36个来自科学家使用我们的平台的引用,我们每天都在看到更多的引用。生物学家、化学家和许多其他生命科学家在出版物、预印本、会议论文、文章,甚至在他们的毕业论文项目中都引用了opentron !我们很高兴能成为这些项目的一部分,也很高兴能与你们分享。

以下是一些Opentrons的引用:

我们将增加更多,所以继续检查这个页面!___________________________________________________

新型冠状病毒肺炎

论文:基于高通量共轭的自动化合理应变构建

一篇来自于j研究中心概述了一个自动端到端分子生物学克隆程序,使用OT-2作为遗传工程工作流程的一部分。这里的一个摘录:

*决定使用两种不同的液体处理系统的动机是需要最有效地使用实验室设备:只要可能,OT-2被用于执行一个单元操作。这与更昂贵的EVO 200相比节省了时间,因此可以用于要求更高的实验....为了使工作流尽可能容易访问,最好只使用OT-2。

请阅读ACS上的论文

论文:两种用于SARS-CoV-2检测的低成本自动RNA提取方法的评价

一篇来自于拉巴斯大学医院详细介绍了在SARS-CoV-2检测中用于高通量RNA提取的两种低成本自动化协议。这里的一个摘录:

*在10天内收集了141份SARS-CoV-2阳性样本。内部协议是基于磁珠提取技术,设计用于Opentrons OT-2液体处理机器人或MagMAXTM Express-96系统。

在公共图书馆读报

论文:ROBOCOV:一种可负担得起的RT-qPCR SARS-CoV-2检测开源机器人平台

一篇来自于巴塞罗那医院诊所展示SARS-CoV-2 RT-qPCR自动化可重复工作流程。这里的一个摘录:

由Opentrons开发的价格低廉的OT-2开源液体处理机器人的出现,为低成本的自动化解决方案打开了大门。这些工作站最初的设想是在研究实验室中执行简单的移液任务,可以串联起来产生更复杂的工作流程。

阅读bioRxiv的预印本

论文:包含:为COVID-19自动诊断进行优化的开源集装箱实验室
科学家的一篇论文OpenCell生物伦敦国王学院详细介绍了如何创建一个模块化的生物安全级别2+实验室,以一个标准的40英尺集装箱为基础,对COVID-19病毒进行自动化RT-qPCR检测。这里的一个摘录:

我们为开源和低成本的Opentrons OT-2液体处理器开发了自动的RNA提取和qPCR板制备协议……使用开源硬件和试剂可以让实验室绕开有限的供应链。与其他液体处理机器人相比,OT-2液体处理机器人具有较低的初始成本,可以使用通用塑料制品,并运行编程语言Python编写的协议。

阅读bioRxiv的预印本

论文:利用开放硬件减轻COVID-19对全球卫生系统的负担
一篇总结为预防、治疗和诊断而开发和部署的免费和开源科学和医疗硬件的论文。这个研究小组由苏塞克斯大学引用Opentrons的COVID-19监测测试系统开源硬件平台。这里的一个摘录:

…以opentron为例,一个开源实验室自动化平台,已与BP基因组公司和开放医学研究所合作,每日自动化测试多达2400次,并获得美国FDA EUA批准,目前正在巴塞罗那医院诊所的生物医学诊断中心(CBD)自动化COVID-19检测……

读报纸公共科学图书馆生物学


微生物学

论文:小鼠喂食致肥的西方饮食,给予抗生素,并接受无菌手术治疗,会发展成具有多药耐药病原体的致命败血症
一篇描述肥胖的西方饮食对术后感染结果的影响的论文。这个国际研究小组由芝加哥大学在他们的16s rRNA测序管道中使用opentron用于库池。这里的一个摘录:

定量结果用于标准化PCR产物用于测序的DNA数量,并确保每个扩增子在测序过程中被均匀表示。然后,使用运行自定义Python脚本的OpenTrons liquid-handler将这些体积依次整合到单个管中。

读报纸mBio

论文:与大学生一起催化快速发现金沉淀细菌谱系
一篇来自于北卡罗来纳州立大学描述了一个跨学科项目,让学生参与微生物的遗传取样、鉴定和分析,Delftia spp。这里的一个摘录:

液体处理程序可能成本高昂,但可以使用更便宜的型号,如Opentrons OT-2,我们正在为该仪器开发脚本。

阅读PeerJ的预印本


实验室自动化

文章:一个DIY方法自动化你的实验室
的一篇文章迈克可能描述如何使用灵活的研究设备解决方案,如Opentrons帮助生物学家节省时间和金钱,并赋予他们更多的定制化。这里的一个摘录:

由于害怕从零开始建造仪器,研究人员可以采取一种折中的方法,修改现有的硬件。例如,格林沃尔德调整了由纽约市Opentrons公司制造的机器人移液系统OT-One,使其在细胞信号传导研究中自动添加试剂和样品成像。

读这篇文章自然

论文:生命科学研究实验室自动化
研究人员的一篇论文爱丁堡大学概述了学术实验室采用自动化工具来增加或取代人工任务以提高效率、节省时间和准确性的困难。这里的一个摘录:

中小型自动化公司往往在实验室设备的创新开发方面最成功,这些公司通过与学术机构合作的赠款计划或外部风险资本资助。例子包括……OpenTrons(原文如此)。

读这篇文章生物工程和生物技术前沿

论文:利用机器人液体处理解锁基因组实验室的效率
研究人员的一篇论文夸祖鲁-纳塔尔大学的描述了基因组学实验室投资于液体处理自动化的日益增长的趋势,以使高通量下一代测序(NGS)工作流程更高效和成本效益。这里的一个摘录:

开源编程机器人自夸是最灵活的液体处理系统。Opentrons机器人在协议设计方面是完全模块化的,新的协议或实验件可以很容易地编码到一个通用的编程接口。

请阅读BMC Genomics的这篇论文


合成生物学

预印:DNA- bot:一种低成本、自动化的合成生物学DNA组装平台
预印本来自于伦敦帝国理工学院详细介绍了他们如何为各种合成生物学应用创造了一种全自动DNA组装方法。这里的一个摘录:

自动化的DNA组装使更大的构建使用更少的研究时间,增加了可访问的设计空间。然而,这些好处目前导致了设备和消耗品的高成本。在这里,我们通过引入基于opentron (DNA- bot)的低成本DNA组装来解决这一限制。

阅读bioRxiv的预印本

文章:提高合成生物学的再现性
一篇文章来自诺和诺德基金会生物可持续性中心在丹麦,他描述了缓解合成生物学中再现性问题的方法,并将opentron作为构建未来的关键部分。这里的一个摘录:

Opentrons最近在Kickstarter上发起了一项活动,旨在解决低成本和灵活的液体处理器的需求。由此产生的OT-One机器人在学术界和工业界都很受欢迎,使Opentrons在实验室自动化领域建立了自己的地位。

读这篇文章生物工程和生物技术的前沿

造纸:利用自动液滴微流控技术快速生产和回收细胞球体
瑞典研究人员的预印本SciLifeLab描述了使用Opentrons液体处理机器人来流线型加载微流体的方法。这里的一个摘录:

作为一种连续相,使用了含1% PEG-PFPE两亲性嵌段共聚物表面活性剂(Ran Biotechnologies)的氢氟醚(HFE, 3M™Novec™7500工程流体)。在移液机器人(Opentrons OT-One-S Hood)的帮助下,将1ml HFE和1%的表面活性剂加入到连续相储层中。这启动了微通道,限制在微流体通道网络中所困空气的最小数量。

阅读SLAS技术中的论文NCBI抽象

海报:用于组装和测试基于重组酶状态机的遗传电路的灵活的自动化平台
波士顿大学的海报潮湿的实验室详细介绍如何创建更好的、易于使用的、可扩展的基于自动化重组状态机(RSM)的遗传电路。这里的一个摘录:

我们的标准化RSM装配流水线利用OT-2 (Opentrons)低成本液体处理机器人探索Gibson (Synthetic Genomics)和帝国理工学院ref (Imperial College-REF)的方法。

网上浏览海报


遗传学与基因编辑

预印本:旨在阻碍进化的合成遗传密码
预印本来自于斯坦福大学描述了蛋白质编码序列点突变的产生和测试大肠杆菌。这里的一个摘录:

我们在体外实验中表明,一组减少的21个tRNA能够表达一种蛋白质,其编码序列被重新编码以使用故障安全码,而标准代码编码不表达。

阅读biorXiv的预印本

预印本:PlasmoTron:疟疾寄生虫自动化培养的开源平台
来自研究人员的预印本桑格研究所描述一种廉价的开源实验室自动化系统来自动化疟疾寄生虫培养。这里的一个摘录:

仅仅是寄生虫病的概念,以及维持血液和培养基这两种不同培养成分的正确比例的需要,都是寄生虫学所独有的,因此很难在非为这一相对定位目的而设计的商业系统中实施。一种潜在的解决方案是OpenTrons系统,它比任何其他液体处理系统都要便宜得多,而且非常灵活,这意味着它有可能适应疟原虫培养的特殊要求。

阅读biorXiv的预印本

论文:FusX:用于基因组科学的快速一步式转录激活因子样效应体组装系统
研究人员的一篇论文梅奥诊所介绍了一种新颖、低成本、自动化、流线型的金门传说装配系统FusX,以及它在斑马鱼基因编辑方面的应用。这里的一个摘录:

我们表明,FusX系统可以很容易地使用实验室自动化工具,即OpenTrons液体处理机器人,从而使该协议在silicon TALEN设计工具中快速扩展。

读报纸人类基因治疗


蛋白质组学

论文:全自动样品处理和分析流程的低输入蛋白质组分析

研究人员的一篇论文杨百翰大学描述了一个完全自动化的平台,仅使用商用仪器进行样品处理和分析蛋白质图谱。这里的一个摘录:

在当今市场上的许多自动化液体处理系统中,OT-2因其低廉的价格(目前为5000美元,加上配件的成本)而特别具有吸引力,许多实验室都可以使用。

读报纸分析化学


内分泌学

论文:用机械适体化电化学阅读器测量黄体生成素搏动性
研究人员的一篇论文香港大学描述一种新的方法自动黄体化激素搏动为生殖疾病的快速临床诊断。这里的一个摘录:

我们报道了一种用于测定黄体生成素搏动性的机器人适配体电化学读取器(RAPTER)电化学分析系统的开发和应用。

读报纸自然通讯


论文

论文:机器人-松乐:自动组合生长表型的机器人系统
杰里米·金博的硕士论文伊利诺伊大学描述一个流线型的、自动化的分析管道来创建微生物生长表型。这里的一个摘录:

这个项目,robot-trifle,是一个分析管道,用于简化为已知的微生物在培养基中生长的最小化学定义培养基的自动化构建。[…这个项目中使用的机器人本身是Opentrons提供的一个开放硬件自动复制器。

读杰里米的论文


同样,这些只是Opentrons使用方式的一个示例。我们已经知道我们的社区正在进行一些非常令人兴奋的研究,论文将在秋季发布,所以请继续关注!等它们公开了我们再分享。

我们会定期更新这个列表。请过来看看吧!

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