自动化如何有助于确保优质的DNA

优质的DNA是许多生命科学应用的关键。自动化可以帮助确保它。就是这样。

下一代测序(NGS)和QPCR应用今天占据了许多生命科学领域,从基本研究到临床诊断和药物发现。这些应用是高度敏感的,需要科学家以高质量的DNA开始,以获得可靠和有意义的数据。

虽然没有正式的标准来定义良好的DNA,但有一种普遍的理解,它是高完整性的,没有杂质,以及手头施用的合适浓度。

良好的DNA有完整性

完整性是指DNA样品的整体嵌入性,并考虑到劣化和剪切。您的应用程序将确定样品中的DNA片段的大大和完整,您应该相应地优化您的隔离方法。例如,如果分离基因组DNA用于PCR克隆,则通常可以脱离一定程度的碎裂和降解。然而,对于需要高分子量DNA的定量应用和工作流程,例如长读取测序,您应该旨在实现最高的完整性的DNA。

通过剪切可以容易地损害DNA样品的整体嵌体性,当手动移液时甚至通过施加过多的力时,可以发生这种情况。自动化通过提供对混合速度和重复的一致控制来消除这种危险。这确保了样本尺寸和结果中的一致性和可靠性,以及减少用户错误的机会。

良好的DNA是纯粹的

理想情况下,您的DNA样品应该仅在其洗脱液或储存缓冲液中由DNA组成。一种常见的杂质来源是从DNA分离和纯化过程中携带,例如有机溶剂和盐。根据样品类型,原始样品中存在的其他材料可能会在分离和纯化过程中存活,例如微生物和植物代谢物,颜料和细胞壁组分和其他杂质。任何其中可能干扰或甚至抑制工作流中的下游步骤,因此应该被移除。

由于自动化使用磁珠来获得样品纯度而不是手动过程,因此可以更有效。当添加到样品中时,这些珠子吸引并将不需要的材料绑定到自己。然后磁铁将珠子保持在管的底部,向下绘制珠子和不需要的颗粒,同时可以洗涤剩余的样品并为工作流程的下一步骤做好准备。这是一个例子核酸纯化方案来自OpenTrons协议库

良好的DNA具有适当的浓度

虽然DNA浓度本身并不总是具有低浓度的低生物量样本的直接测量质量 - 低生物量样本 - 准确测量DNA浓度的能力是大多数应用的质量控制过程的关键部分,特别是在定量分析的情况下进行,或者在下游工作流程需要特定DNA浓度,如微生物克隆或NGS。

如果您想讨论自动化如何帮助您的DNA净化工作流程,我们很乐意通过免费电话咨询来帮助您使用它。