opentron用户访谈Brian Sørensen和仪器开发商Fidabio的Henrik Jensen

Fidabio使用OT-2和Opentrons Python协议API创建了分析蛋白质相互作用的设备,用于生物药物开发。这是如何。

Brian Sørensen是公司的首席执行官Fidabio。亨利克·延森是中央情报局。Fidabio为生物药物开发创造了分析蛋白质相互作用的设备。他们使用一个Opentrons OT-2液体搬运机器人Opentrons Python协议API自己的软件建立复杂的样品制备稀释流程。这是如何。

Brian Sørensen(左)和Henrik Jensen(右)。资料来源:Fidabio
Brian Sørensen(左)和Henrik Jensen(右)。资料来源:Fidabio

奥本创:请给我们介绍一下你的背景。

布莱恩·Sørensen:我们在哥本哈根大学直到去年年底。

Henrik Jensen:在大学里,我们使用Opentrons OT-2机器人进行了系列稀释制样工作流程,生成结合伙伴溶液需要大量的移液工作。一旦我使用了它,我意识到它可以在实验室中更好地进行整体集成。

奥本tron:你们从事什么样的研究工作?

布莱恩·Sørensen:我们的内部试验是典型的小型实验,可以使用手动移液。然而,我们的客户在进行更大规模的实验时,没有必要让技术人员用移液管更快地完成实验;机器人可以移液,科学家可以进行分析。当实验涉及到更大的稀释系列,或更多的样品需要报价,你应该考虑自动化。举例说明这一点的一个项目是,一个客户分析了来自附近一家医院的数千个病人样本。

奥本聪:你为什么选择OT-2?

布莱恩·Sørensen:我们购买了一个独立的液体处理机器人,但我们很快意识到,我们可以将它与我们自己的软件集成在一起。

Henrik Jensen:自动化的优势显然在于处理大量的样品,否则手工操作将是重复的。此外,准确性在湿实验室工作中也很重要:如果你能以一种标准化的方式进行工作,它将提高结果。对于相对较小的样本量来说,这一点尤其重要。自动化让这一切变得简单多了。

布莱恩·Sørensen:可重复性是关键,当你在实验室中增加人为因素时,它不会增加可重复性。

Henrik Jensen:第三,如果你能使用机器人,对操作人员的知识和技能将会更小的整个工作流程。

布莱恩·Sørensen:如果您正在做一些常规的分析,那么您可以手动做所有的事情。但这可能不是完成整个试验的最佳方法,也不是对技术人员的最佳利用。

Henrik Jensen:有了液体处理机器人,它更容易记录你的研究,因为你可以分享移液脚本和研究人员可以复制数据。自动化提供了一个非常详细的解释,说明您可以做什么——以及做了什么——做了什么。

布莱恩·Sørensen:如果你想把你的实验从一个实验室转移到另一个实验室,它有手工步骤

Henrik Jensen:-自动化更容易。这个因素也是我们自动化准备和整个工作流程动机的一部分。

布莱恩·Sørensen:最初集成OT-2时,人们主要认为它是一个很好的利基应用程序。但是,我们看到更多的客户也有兴趣将OT-2作为他们Fidabio工作流的一部分。我们可以在软件中看到无缝集成更多的实验室。这就是为什么Fidabio的软件和opentron可以连接在一起。

在Fidabio的软件平台上集成Opentrons。信贷:Fidabio
在Fidabio的软件平台上集成Opentrons。信贷:Fidabio

opentron:你的OT-2启动并运行是什么感觉?

Henrik Jensen:这种体验基本上就是把它插进去。从硬件的角度来看,这很容易。当然,使用这些协议需要学习一些东西,但并不一定很难。我们的软件工程师Morten编写了脚本。它们很容易创建。

布莱恩·Sørensen:可以说,OT-2无缝地融入了我们的工作流程。它简化了生成结合曲线的工作,这需要进行稀释滴定和大量的移液。我们的系统和其他自动化湿式实验室系统都很适合把这个工作留给机器人,而不是占用技术人员的时间。它是一个端到端的自动化工作流。

Henrik Jensen:我们以前没有这方面的经验。但是,当然,我们自己也是工具开发人员,所以我们已经对过程有了很好的理解。

opentron:在使用OT-2之前,你使用过实验室自动化吗?你认为实验室自动化的过程会是怎样的?

布莱恩·Sørensen:当我们开发自己的平台时,高度自动化对我们来说很重要。从这个意义上说,OT-2是我们的一个关键卖点的一个很好的增强。它与我们平台上的一个关键元素很好地结合在一起。

Opentrons:你具体用OT-2做什么,它是如何融入你的工作流程的?

布莱恩·Sørensen:对我们来说,我们出售的仪器必须非常精确。我们知道我们的技术有能力提供非常准确的数据,但这仍然是生物学,即使很小的变化也会影响结果。对于我们所从事的应用,例如药物发现,我们必须确保我们尽可能多地控制实验。控制准备过程的能力会带来更好的结果。

Henrik Jensen:在我们集成之前,我们有一个分析开发合作伙伴,允许我们将信息输入到系统中,系统会计算出你需要什么来制作解决方案。当然,您可以手动完成此操作。我们的下一步是为OT-2编写脚本,而不是手动编写。

奥创:你们还计划其他的自动化吗?

布莱恩·Sørensen:我们一直在寻求进一步的发展。我们仍然是一家年轻的公司。但我们正在迅速行动,进一步的整合很有可能。

opentron:关于使用OT-2,您还有什么想说的吗?

Henrik Jensen:开放性和与多个平台集成的能力是你的产品的一个非常重要的特性。

布莱恩·Sørensen:我们已经和你们的产品开发团队讨论了进一步的整合方式,为我们的客户提供无缝顺畅的工作流程,并提高用户效率。在目前的市场上,这也是一种非常有需求的东西。我们在客户身上看到的反复出现的趋势——对量化和准确性的需求日益增长——以及实验室工作流程变得越复杂,要求就越多……并且越需要消除误差源。实验室自动化的驱动力不是自动化本身,而是它所能提供的:最高质量的数据。

Henrik Jensen:自动化不仅仅是为任何实验室创造出一种更便宜、更容易获得的产品。你还必须思考这种方法如何你可以自动化。你必须从整个过程来思考。

布莱恩·Sørensen:生物技术长期以来一直在努力解决这个问题。客户寻找的是答案,而不仅仅是数据。他们在寻找能帮助他们做决定的东西。他们越快找到解决方案,他们的开发过程就越高效。这是这一过程中的一个重要突破。

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