使用opentron测试COVID-19

opentron COVID-19检测系统可以帮助开展公共卫生监测项目的实验室立即扩大规模,每天筛查2400次检测。

可伸缩的自动化解决方案

Opentrons的使命是通过更广泛的实验室机器人技术来加速生命科学的发展。世界现在比以往任何时候都更需要这种能力。

Covid-19的人口规模测试是限制死亡率的最好方法之一大规模的检测可以迅速发现和隔离感染,限制病毒的传播,保护弱势群体。为了恰当地调查人口,需要处理数百万个COVID-19检测试剂盒。世界各地的组织都在努力尽快提高他们的能力。

这是挑战的类型是为了满足。

OpenTrons'Covid-19测试系统是运行Covid-19公共卫生监测项目的实验室的最佳解决方案,需要立即扩大到自动化操作。OpenTrons可以安装在订单的订单中每天自动化最多2,400个测试的系统。我们目前正在部署此监视能力开放医学研究所在加州的帕洛阿尔托,很快会有更多的监控项目跟进。

我们可以与任何试剂提供者合作,甚至为最佳和最实惠的选择提供建议如果您是需要扩大COVID-19监测工作规模的实验室,请通过以下方式与我们联系covid-19@www.panhunting.com

Opentrons和开放医学研究所渴望与地方和联邦机构合作,以确定该系统是否可以用于临床诊断紧急使用授权(EUA),并提供测试带宽,以满足苛刻的高和增长的需求。

以下是我们开发的系统的详细信息,以及如何将其用于COVID-19的大规模测试。

测试过程

与许多传染病检测方法一样,检测COVID-19病毒的方法使用定量聚合酶链反应(qPCR)技术。在COVID-19这样的冠状病毒的情况下,这种检测方法实际上是一种逆转录酶qPCR (RT-qPCR)因为它测量的是RNA而不是DNA。RT-qPCR能够检测从患者样本纯化的RNA中COVID-19目标序列的存在和水平,这可以告诉你某人是否感染,如果感染,大约会持续多久。

第一步是收集样品。收集在医生订购测试后发生。医院,实验室和公共卫生设施擦拭患者的鼻子或嘴,并立即将测试拭子放入管中。然后将这些患者样品安全地带到测试实验室。

收集管到实验室后,有三个自动化步骤:

  1. 样品电镀
  2. RNA提取
  3. QPCR设置

每个步骤都有一个指定的OT-2工作站(化验除外,化验在实验室提供的qPCR仪器上进行)。下面是如何在Opentrons上自动化这个过程:

站一个-样品电镀:96带有患者样品的收集管悬浮在失活缓冲液中,放在第一个Opentrons机器人上以进行RNA提取。机器人移液器样品和从管中的阳性对照进入深层板。

A站配置:9050美元

  • p20 + p300单通道移液器
  • 温度模块(主动降温控制RNA)
  • 4 x管架
  • 96深井抽提板
  • 1x机架20ul + 1x机架200ul过滤嘴
A站OT-2甲板布置
A站OT-2甲板布置

A站应该在某种类型的“入口”房间里。这个工作站的主要瓶颈通常不是实际的重新格式化,而是为机器人标记、记录、打开盖子,并将收集管装载到机架上。为了防止污染,最好将进样室与任何样品处理的地方分开。样品和阳性对照RNA放入深井板后,即可移至B站。

站B - RNA提取:使用磁性微珠将96个含有样品的样品移动到第二机器人,用于RNA提取。这是由于完全净化RNA所需的许多洗涤步骤,这是自动化过程的大部分。

基站配置:$7,750

  • p300举办吸管
  • 188手机开奖结果
  • 96深井抽提板
  • 96井洗脱板
  • 5x机架的200ul滤芯
  • 2x个12道试剂储藏库
  • 21通道液体垃圾蓄水池
RNA提取的OT-2甲板布局
RNA提取的OT-2甲板布局

也应该有一个专门的提取室,所有的B站提取机器人都被安置在那里。如果吞吐量需要,这个房间还可以容纳一个试剂填充站,准备磁性微珠和缓冲液,用于B站机器人进行RNA提取。正如你在上面的甲板图中看到的,有很多试剂和技巧需要这个过程。

C站-化验设置:从样品(洗脱)中分离的RNA被移动到容纳QPCR仪器的第三室,并且设计为尽可能最小化污染的“清洁”。将具有纯样品RNA的板置于取代机器人上,以预制RT-QPCR测定。

C站OT-2配置:7500美元

  • p20单通道
  • Opentrons温度模块
  • 96井洗脱板
  • 96井PCR板
  • 3x架20ul滤芯
RT-qPCR的OT-2甲板布局
RT-qPCR的OT-2甲板布局

RT-qPCR所需的试剂被单独放置在主动冷却的温度模块上。这些混合物被组合成一个主混合物,然后被分配到一个盘子,并与纯化的RNA结合。在此过程结束后,将平板放入qPCR机,分析COVID-19是否存在。

吞吐量

我们开发了一个8个机器人(2x站A,4x站B,2x站C)的系统,可以每12hrs准备12个96孔板,或约2,400个测试/天。

这就是这个过程的时间是如何在8机器人系统中被打破的:

该系统加上备件和实验室安装可用于监控项目100,000美元。我们可以通过3月1出每周安装这些系统的安装,然后在4月份每周安装4倍的系统安装。如果我们实现这一坡道,我们可以预期在6月底之前自动对Opentrons系统进行1M测试。

我们目前正致力于在加利福尼亚州帕洛阿尔托的开放医学研究所安装第一批高吞吐量系统,并渴望使用我们的机器人来援助实验室完成这个关键的项目。

如果您有兴趣使用OpenTrons以扩展您的实验室运行Covid-19测试的能力,请联系covid-19@www.panhunting.com