开源的力量在生物学- k Biofoundry湿实验室的10美元

一个强大的生物铸造厂不需要几百万美元的投资——廉价的开源工具让每个实验室都能拥有这些能力。

潮湿的实验室是波士顿大学新生物设计中心的一家羽翼未丰的生物铸造厂。使用不到1万美元的开源软件和硬件,该实验室能够提供30个合成生物学协议(如DNA组装、转化、测序、质粒纯化等),作为对科学界收费的服务。任何科学家都可以通过DAMP lab web界面远程指定一个实验计划,他们的自动化系统可以设计、构建和测试该计划。

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他们是怎么做到的?

通过集成一些开源工具,该实验室可以迅速开发出一个复杂的系统,有效而优雅地自动化生物电路测试。使用的一些关键开源工具有:

  • 大提琴使用Verilog编程语言实现生物电路的自动化设计。

  • 水族馆为LIMS启用作业排队和库存管理

  • Opentrons”OT-2移液机器人,用于自动化DNA装配、转换和许多其他协议。

你可以在Synbiobeta博客上阅读更多关于DAMP实验室的技术堆栈在这里

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为什么潮湿实验室的生物铸造和开源很重要?

在这段视频中,DAMP实验室谈到了他们的开源技术以及它赋予他们的能力。

该项目展示了实验室中开源软件和硬件的力量。当手动执行所有这些过程时,潮湿实验室将花费一周的时间来设计、建造和测试10个基因电路。在开源技术上的投资相对较少,阻尼实验室的吞吐量是它的10倍。

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其结果是,在相同的设备和团队下,阻尼实验室能够执行10倍的实验。开源工具提高了生产率,大大降低了执行复杂实验的成本。

一个强大的生物铸造厂不需要几百万美元的投资——廉价的开源工具让每个实验室都能拥有这些能力。

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