验证的工作站应用程序
自动化NGS库准备工作站
概述
新一代测序（NGS）是生命科学的许多极其重要领域的基础，但制备样品进行测序是一个艰苦的，细致的工艺。伴随着经过验证的协议，机器人技术和高品质的试剂的Opentrons自动NGS库准备工作站，使几乎所有的实验室开始自动化NGS文库制备端至端。
将你的样品上的OT-2实验室机器人之后，它将进行酶制剂，结扎，并使用温度模块保持你的试剂冷却设置扩增。然后，它将使用自动上甲板热循环仪模块运行PCR步骤和上磁模块执行基于珠的清理。188手机开奖结果
这Opentrons工作站包括所有你需要开始自动化NGS库准备在实验室中的一切;对OT-2机器人热循环仪模块，温度模块，磁模块，实验室器皿，夫特Bioscience公司文库制备试剂盒，和Omega生物T188手机开奖结果EK磁珠。
此工作站可用于以下应用程序：
- 全基因组测序（WGS）
- DNA测序
- Metagenomic测序
- 长程PCR扩增子
- RNA测序起始用全长，双链cDNA的输入
- 检测种系继承的SNV和indels
- 拷贝数变异检测
- 相关的基因组区域（即外显子组）或感兴趣的成绩单杂交捕获
表现
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准确度：1UL的准确性：15％
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精度：在1UL 5％
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吞吐量：在22秒内快速填充96孔板
更新
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支持以太网或USB连接（提供外部加密狗）
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4 USB端口可用于支持多个模块的连接
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通过外部PCBA机箱轻松访问电子
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LED指示器为用户提供反馈，诊断和故障排除辅助仪器电源状态，系统处理，以太网和网络连接
方便使用的
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自助装箱和安装
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试剂和珠子系统不可知
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即插即用设置，可以访问协议库以启用即时测定实现
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轻松集成到现有的仪器
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兼容ANSI / SBS兼容或自动化友好的管，微孔板，深井板，储层和适配器
Opentrons材料
好处
只需加载您的试剂在机器人，打“跑”，让工作站从端到端自动化您的NGS库准备。
- 8个样品在2小时50分钟
- <$ 30 /样品试剂+消耗品
- 甲板上PCR消除了中期经营人为干预
- <15分钟的实践准备
应用程序数据
从100纳克E.构成每个库大肠杆菌基因组DNA导致的近似产率远高于在单次运行用于测序所需要的最小量用6％CV（变异系数）跨越重复。文库用引物特异于Illumina的P5和P7适配器量化索引10个PCR循环后扩增的库。所构建的文库显示539碱基对的平均峰片段大小，产生约每库34纳米。
图1
库上面所示出的迹线与〜560 bp的预期峰值高度在Agilent片段分析器以高灵敏度NGS片段程序的OT-2构成。
图2.
基因组覆盖范围仍然存在于输入的DNA浓度上。在OT-2上准备的图书馆显示比手动制备的库类似或更大的覆盖范围。
笔记
试剂
此应用程序已经全面测试，并与我们的合作伙伴试剂，生物科学斯威夫特和Omega酶标仪科学证实。我们建议您使用SWIFT™2S涡轮DNA文库试剂盒和Omega酶标仪幅度 - Bind®TotalPure NGS珠这种应用。如果你想使用另一种试剂盒或不同的珠子，为DNA的OT-2支持各种试剂清理。
实验室
此应用程序已通过OpenTrons LabWare进行了验证，包括96孔PCR板，2毫升管，12孔水库和Opentrons提示。如果您有不同的实验软件要求，请联系我们的销售团队，讨论此协议的修改以满足您的需求。
移液器
我们建议您使用此应用程序的P50或P20单道移液器和P300 8道移液器。如果你有不同的容量要求，请联系我们的销售团队询问有关协议的修改。
