验证的工作站应用程序
自动NGS图书馆准备工作站
概述
下一代测序（NGS）是许多至关重要的生命科学领域的基础，但是准备测序样本是一个艰辛，细致的过程。Opentrons Automated NGS库准备机器人技术和高质量试剂的工作站伴有经过验证的协议，使几乎所有实验室都能开始自动化NGS库库的终端准备。
将样品放在OT-2 Lab机器人上后，它将使用温度模块进行酶促制备，结扎和设置放大，以使试剂冷却。然后，它将使用自动的甲板热环体模块运行PCR步骤并在磁模块上执行基于珠子的清理。188手机开奖结果
此Opentrons工作站包括您在实验室中开始自动化NGS库准备所需的一切；带有热环体模块的OT-2机器人，温度模块，磁模块，实验室，Swift Bioscience库准备套件和Omega Bio-188手机开奖结果Tek磁珠。
该工作站可用于以下应用程序：
- 整个基因组测序（WGS）
- DNA测序
- 元基因组测序
- 远程PCR扩增子
- RNA-seq从全长，双链cDNA输入开始
- 检测种系遗传的SNV和INDELS
- 拷贝数变化检测
- 杂交捕获相关基因组区域（即外显子组）或感兴趣的转录本
表现
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准确性：1英镑15％
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精度：1英寸为5％
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吞吐量：在22秒内快速填充96孔板
更新
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支持以太网或USB连接（提供的外部加密狗）
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4个USB端口可用于支持多个模块的连接
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轻松通过外部PCBA机箱访问电子设备
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LED指标为用户提供有关仪器功率状态，系统处理，以太网和网络连接性的反馈，诊断和故障排除辅助
方便使用的
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自助式拆箱和安装
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试剂和珠系统不可知论
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可以访问协议库的插件设置，以启用即时测定实现
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轻松地集成到您现有的乐器
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与ANSI/SBS兼容或符合自动化的友好管，微孔板，深井板，储层和适配器
Opentrons材料
好处
只需将试剂加载到机器人上，点击“运行”，然后让工作站从头到尾自动化您的NGS库准备即可。
- 2小时50分钟中的8个样品
- <$ 30 /样品试剂 +消耗品
- 甲板上的PCR消除了中期的人类干预
- <15分钟动手准备
确认
该应用已经过全面测试和科学验证，通过试剂合作伙伴Swift Biosciences和Omega Bio-Tek。
查看我们的申请注释，概述了Swift Biosciences验证过程这里。
查看我们的申请注释，概述了Omega Bio-Tek验证过程这里。
应用程序数据
每个库由100 ng的大肠杆菌基因组DNA构建，在单个运行中重复构造6％CV（变异系数）测序的最小必需数量远高于最低量。在10个索引PCR循环后，用特定于Illumina P5和P7适配器的引物对文库进行扩增。构造的库的平均峰片段大小为539 bp，每个库约为34 nm。
图1
在上面显示的OT-2上构建的库显示了一个带有高灵敏度NGS片段程序的敏捷片段分析仪的预期峰高约为560 bp的迹线。
图2
在输入DNA浓度之间，基因组覆盖率保持一致。在OT-2上准备的库显示的覆盖范围与手动准备的库相似或更大。
笔记
试剂
该应用已通过我们的试剂伙伴，Swift Biosciences和Omega Bio-Tek进行了全面测试和科学验证。我们建议您将Swift 2S™Turbo DNA库套件和Omega Bio-Tek Mag-Bind®TotalPureNGS珠子用于此应用程序。如果您想使用另一个套件或不同的珠子，则OT-2支持各种DNA清除的试剂。
实验室
该应用程序已通过Opentrons Labware进行了验证，包括96孔PCR板，2毫升管，12孔储层和Opentrons提示。如果您有不同的实验室要求，请与我们的销售团队联系以讨论此协议的修改以满足您的需求。
移液器
我们建议将P50或P20单通道移液器和P300 8通道移液器用于此应用程序。如果您有不同的量要求，请与我们的销售团队联系以询问协议修改。
